تهدف جامعة المثنى الى:

أولا : تأهيل طلبة قادرين على مواكبة متطلبات سوق العمل 

ثانيا : تقديم الخدمات العلمية الى المجتمع والسعي الى تنميته 

ثالثا : تحسين الالداء المؤسسي , وضمان جودة العملية التعليمية 

رابعا: التطوير الاداري , وتحسين اساليب العمل بأتجاه التحول الى النظام الرقمي, والحوكمة الالكترونية 

خامسا : ايجاد بيئة داعمة للبحث العلمي تتلائم مع تنمية المجتمع

سادسا : تطوير البنى التحتية وتنمية استدامة البيئة الاكاديمية واشاعة الاجواء الاكاديمية