تهدف جامعة المثنى الى:
أولا : تأهيل طلبة قادرين على مواكبة متطلبات سوق العمل
ثانيا : تقديم الخدمات العلمية الى المجتمع والسعي الى تنميته
ثالثا : تحسين الالداء المؤسسي , وضمان جودة العملية التعليمية
رابعا: التطوير الاداري , وتحسين اساليب العمل بأتجاه التحول الى النظام الرقمي, والحوكمة الالكترونية
خامسا : ايجاد بيئة داعمة للبحث العلمي تتلائم مع تنمية المجتمع
سادسا : تطوير البنى التحتية وتنمية استدامة البيئة الاكاديمية واشاعة الاجواء الاكاديمية